Nascido em Lisboa em 1985, Filipe Santos estudou Realização na Escola Superior de Teatro e Cinema. Os seus estudos progrediram para um Mestrado em Escrita de Guião pela New York Film Academy, tendo residido durante dois anos nos Estados Unidos da América. Aqui estagiou em produtoras como Dino de Laurentis e Platinum Studios.
Em 2012 regressou a Portugal, ingressou no mercado de escrita para televisão e trabalhou na SP Televisão, como parte das equipas da novela Os Nossos Dias e da série Bem-Vindos a Beirais. Em 2014 juntou-se à equipa da produtora Ukbar Filmes, como secretário de produção e desenvolvimento. Aqui colaborou em diversos projetos, colaborou na escrita guião de Comboio de Sal & Açúcar, de Licínio de Azevedo, escreveu a curta Ponte na Califórnia, de Pedro Amorim, e a longa-metragem Menina, de Pocas Pascoal, agora em pós-produção.
A partir de 2017 passou a trabalhar como guionista freelancer. Desde então escreveu a curta premiada Calor, de Jacopo Wasserman, a série de animação À Boleia com a Ciência, com a produtora Easy Lab, e recentemente, a série histórica A Travessia, co-escrita com o guionista João Canelo, uma produção da David & Golias.
Presentemente prepara-se para estrear-se na realização com a curta-metragem O Amolador, com guião de João Canelo, seu parceiro de escrita.
